Педиатрический факультет был открыт в 1974 году. Цель его открытия – формирование медицинских кадров для республик Северного Кавказа.
Педиатрический факультет стал вторым в структуре Северо-Осетинского государственного медицинского института после лечебного факультета. Первым деканом, стоявшим у истоков формирования педиатрического факультета, была профессор Эмма Абхазовна Тотрова, замечательный организатор, чрезвычайно много сделавший для факультета. Профессор Тотрова Э.А. продолжила работу на посту ректора вуза.
До открытия факультета педиатрию преподавали на кафедре детских болезней лечебного факультета. Организатором и первым руководителем в 1941 году была доцент Поюровская Е.Я. В последующие годы кафедрой руководили известные клиницисты: профессор Лейтес Б.Г., профессор Чамокова Е.Ф., доцент Ремизов Г.В., доцент Озерянская Р.Т.
За короткое время были сформированы все профильные кафедры на базе лечебно-профилактических учреждений города: госпитальной педиатрии, пропедевтики детских болезней (ныне - кафедра детских болезней № 1), кафедра поликлинической педиатрии, кафедра детских инфекционных болезней (ныне – кафедра детских болезней № 2), кафедра детской хирургии (ныне - кафедра хирургических болезней детского возраста с медицинской генетикой).
Первый выпуск врачей-педиатров состоялся в 1980 году, 80 студентов получили диплом врача. За период существования факультета подготовлено более двух с половиной тысяч врачей-педиатров, добросовестно и успешно выполняющих свой профессиональный долг, сохраняя наше бесценное достояние – жизнь и здоровье детей. В настоящее время обучается 770 студентов.
С 1979 по 1981 гг. деканатом педиатрического факультета руководила доцент кафедры фармакологии Тамара Николаевна Гонобоблева. Высококвалифицированный преподаватель, она активно занималась организационной, учебно-методической, научной деятельностью.
С 1981 по 1985 гг. деканат возглавлял заведующий кафедрой офтальмологии, доцент Короев Олег Ильич. Опытный педагог и замечательный клиницист, он много сделал для факультета.
С 1985 по 1988 гг. деканом педиатрического факультета был заведующий кафедрой оториноларингологии, профессор Георгий Алкивиадович Георгиади.
С 1988 по 2007 гг. деканом педиатрического факультета был заведующий кафедрой организации здравоохранения, профессор Олег Николаевич Гурциев, воспитавший не одно поколение студентов педиатрического факультета.
С 2007 по 2008 гг. деканом факультета была заведующая кафедрой биологии и гистологии, профессор Лариса Владимировна Бибаева.
С 2008 по 2009 гг. деканом была доцент кафедры нормальной физиологии Надежда Викторовна Боциева, уделявшая много времени становлению и совершенствованию педагогического процесса.
Медико-профилактический факультет был открыт в академии в 2001 году. Первым деканом факультета была д.м.н., профессор Кусова Алина Рашидовна, которая в настоящее время возглавляет кафедру общей гигиены и физической культуры.
С 2008 по 2009 гг. деканом факультета являлась доцент кафедры нормальной физиологии, к.м.н. Надежда Викторовна Боциева.
Факультет высшего сестринского образования образован в 2003 году. У его истоков стояла первый декан к.м.н., доцент, заведующая курсом медицинской генетики Фатима Катабиновна Лагкуева.
Факультет сразу же привлек внимание медицинских сестер, желающих получить образование по специальности «Сестринское дело» и стать квалифицированным менеджером.
С 2009 года деканом педиатрического, медико-профилактического факультетов и факультета высшего сестринского образования является доцент кафедры внутренних болезней № 1 Альбина Анатольевна Медоева.
В 2016 г. деканат переименован в деканат педиатрического и медико-профилактического факультетов.
В 2022 г. переименован в деканат педиатрического факультета.