История библиотеки тесно связана с историей вуза. Основанная в 1939 г. библиотека, сопровождала развитие института и всегда являлась ее важной составляющей. Первой заведующей и основательницей библиотеки стала Ася Тиграновна Хитарянц.

В 1939 году библиотека располагалась в здании института по ул. Бутырина 1. Библиотеке была отведена одна небольшая комната. Книг еще не было.

При формировании библиотеки требовалось решить несколько задач: комплектование фонда, оснащение библиотеки библиотечным оборудованием, увеличение штатов и помещений. Большую помощь в решении этих вопросов оказывал директор института С.С.Ханаев.

В сентябре 1939 года библиотека открыла двери для читателей. Ими были первые 100 студентов-первокурсников.

В 1941-1942 учебном году институт получил то помещение, в котором он находится и сейчас. В одном из корпусов разместилась библиотека. Был организован читальный зал на 100 посадочных мест. Большое внимание уделялось формированию фонда читального зала. Комплектовалась библиотека через книготорговые организации Москвы, Ленинграда, Киева, Харькова, Ростова-на-Дону и др., а также путем обмена с другими библиотеками. Книжный фонд был отражен в двух каталогах: алфавитном и систематическом.

В 1941 году по распоряжению Наркомздрава Республики в фонд библиотеки СОГМИ была передана библиотека Дома санитарного просвещения, насчитывающая 1050 экз. книг и 800 журналов.

В начале 1942 года библиотека открыла двери для практических врачей- врачей эвакогоспиталя. Для них был открыт МБА.

Осенью 1942 года учебный фонд библиотеки был эвакуирован в г. Ереван. За время войны библиотекой было утрачено 4720 книг, брошюр, журналов, а также библиотечное оборудование , в том числе и каталоги.

В последующие годы еще дважды переезжает библиотека из одного помещения в другое. Появляются иные возможности и условия работы.

Началась большая работа по организации отделов, оснащению оборудованием, упорядочиванию фондов, организации книгохранилища, созданию алфавитного читательского каталога, созданию кафедральных библиотек.

Сегодня в фонде библиотеки свыше 400 тысяч экземпляров изданий. В фонде есть и редкие издания второй половины XIX века.

С 1999 года началась работа по внедрению автоматизированных технологий в практическую деятельность библиотеки.

Главным ориентиром для библиотеки стало желание цивилизованно развивать свои технологии и предоставлять читателям все богатство мирового библиотечно-информационного пространства.