Инициаторами создания факультета стали ректор медакадемии, профессор К.Д.Салбиев и министр здравоохранения РСО-Алания Г.А.Течиев. В 1992 году было направлено специальное письмо-обоснование на имя министра здравоохранения РФ с просьбой открыть стоматологический факультет при Северо-Осетинском государственном медицинском институте в связи с острой нехваткой квалифицированных кадров в республике. Это стремление было поддержано и руководством республики, которое также обратилось в Минздрав России с аналогичной просьбой.

Так, 1 сентября 1993 года первые студенты стоматологического факультета появились в стенах Северо-Осетинского государственного медицинского института. А в 1995 году была основана стоматологическая поликлиника Северо-Осетинского государственного медицинского института, которая в настоящее время является основной базой для обучения студентов.

Активное участие в налаживании и становлении учебного процесса на новом факультете приняли проректор по учебной работе, проф. Г.А.Георгиади и первый декан стоматологического факультета О.Н.Гурциев.
В 1998 году был осуществлен первый выпуск 40 врачей-стоматологов, 8 из которых получили дипломы с отличием.

В течение всех этих лет существования стоматологического факультета шел непрерывный процесс укрепления кадрового состава факультета, защищались кандидатские диссертации.
На кафедрах стоматологического профиля выполнялась научно-исследовательская работа, готовились учебно-методические пособия, закреплялись патентами научно-технические и научно-практические разработки. В эту деятельность активно вовлекались лучшие студенты факультета.
На факультете идет непрерывный процесс укрепления материально-технической базы: приобретается современное оборудование, компьютерная техника; имеется специализированный фантомный класс для практических занятий; увеличивается количество учебно-лечебных кабинетов, завершился капитальный ремонт стоматологической поликлиники СОГМА.

В настоящее время деканом стоматологического факультета является доктор медицинских наук, профессор Лариса Владимировна Бибаева.

Обучение на факультете ведется в соответствии с требованиями федерального государственного образовательного стандарта высшего образования по специальности 31.05.03 Стоматология. Срок обучения составляет 5 лет.

Обучение проводится на базе стоматологической поликлиники ФГБОУ ВО СОГМА Минздрава РФ, являющейся структурным подразделением академии, а также на базе стоматологических поликлиник республики, челюстно-лицевого отделения РКБ, отделения «голова, шея» республиканской онкологической больницы.
Студенты стоматологического факультета достойно представляют академию на конференциях и олимпиадах различного уровня.

Ежегодно студенты-стоматологи во время прохождения практики совершенствуют свое мастерство, внедряя научные разработки сотрудников кафедры. Прохождение практики является важнейшим компонентом вузовского учебного процесса, служит целям подготовки высококвалифицированных специалистов, способных к самостоятельной практической деятельности.